中國(guó)科學(xué)院上海營(yíng)養(yǎng)與健康研究所所級(jí)科學(xué)數(shù)據(jù)中心于12月5日下午舉辦了“人體微生物組大數(shù)據(jù)分析進(jìn)階”培訓(xùn)，旨在幫助科研人員了解人體微生物組研究的最新發(fā)展和應(yīng)用，并快速掌握常用的分析技術(shù)和方法。本次培訓(xùn)由中心資深工程師李強(qiáng)擔(dān)任主講人，他在人體微生物組數(shù)據(jù)分析和可視化方面具備豐富的實(shí)踐經(jīng)驗(yàn)和專業(yè)知識(shí)。
李強(qiáng)首先回顧了上次人體微生物組數(shù)據(jù)分析和可視化入門培訓(xùn)課程的主要內(nèi)容。隨后，他詳細(xì)介紹了iMAC宏基因組數(shù)據(jù)分析流程，并通過示意圖展示了如何對(duì)宏基因組數(shù)據(jù)進(jìn)行分析，使學(xué)員們更直觀地理解該流程。此外，他還介紹了MetaPhlAn4、Kraken套件等工具，并深入探討了從菌群基因?qū)用嫱诰蛉四c道菌群的“指紋”和影響健康的機(jī)制，以及冰川微生物基因組研究等相關(guān)內(nèi)容。最后，他通過實(shí)際操作演示了iMAC平臺(tái)的數(shù)據(jù)分析過程，包括數(shù)據(jù)背景、測(cè)序準(zhǔn)備工作、使用iMAC平臺(tái)進(jìn)行分析、生成結(jié)果文件、數(shù)據(jù)質(zhì)控、結(jié)果解讀、序列比對(duì)注釋、功能注釋、代謝物預(yù)測(cè)、VF \ ARF豐度計(jì)算等環(huán)節(jié)。學(xué)員們積極參與，踴躍發(fā)言，并進(jìn)行了深入的交流和討論。
通過本次培訓(xùn)，學(xué)員們更加熟悉了iMAC微生物組學(xué)分析平臺(tái)的使用，包括微生物組數(shù)據(jù)分析參數(shù)解析和任務(wù)提交管理，以及如何解讀分析結(jié)果等。這將使學(xué)員們更深入了解所級(jí)科學(xué)數(shù)據(jù)中心提供的常規(guī)生物信息分析服務(wù)，并為科學(xué)研究提供有力支持。
營(yíng)養(yǎng)與健康所所級(jí)科學(xué)數(shù)據(jù)中心將繼續(xù)舉辦相關(guān)主題的培訓(xùn)活動(dòng)，以幫助更多的科研人員掌握生信常規(guī)分析等服務(wù)。同時(shí)，所級(jí)科學(xué)數(shù)據(jù)中心也歡迎科研人員提出寶貴意見和建議，以進(jìn)一步完善和提升服務(wù)質(zhì)量。
李強(qiáng)工程師作培訓(xùn)報(bào)告
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