2019年7月3日，國際著名學術期刊Cell Stem Cell在線發(fā)表了題為“A Homeostatic Arid1a-Dependent Permissive Chromatin State Licenses Hepatocyte Responsiveness to Liver-Injury-Associated YAP Signaling”的研究論文。該研究由中國科學院分子細胞科學卓越創(chuàng)新中心惠利健研究組與中國科學院上海營養(yǎng)與健康研究所李亦學研究組合作完成。該研究發(fā)現(xiàn)染色體重塑調控蛋白Arid1a介導肝細胞重編程基因在正常的肝細胞中預打開，使肝細胞具有響應損傷誘導的YAP信號而轉錄激活重編程基因的潛能，揭示了肝細胞去分化可塑性的分子基礎。
李亦學研究組長期從事組學大數(shù)據(jù)相關的算法開發(fā)和數(shù)據(jù)挖掘，并將其應用于腫瘤等復雜疾病的研究。在這項最新的研究進展中，研究團隊通過構建肝細胞中Arid1a敲除的缺陷小鼠，發(fā)現(xiàn)Arid1a缺失會抑制肝臟損傷修復。鑒于Arid1a作為染色質重塑復合體的重要組分，科研人員通過ATAC-seq技術研究染色質開放區(qū)域。發(fā)現(xiàn)在肝臟正常狀態(tài)時，Arid1a通過賦予肝細胞重編程基因染色質預打開的狀態(tài)，幫助肝細胞能夠快速應對損傷信號，避免劇烈的染色質重塑。同時結合ChIP-seq和RNA-seq，科研人員識別了轉錄因子Yap響應Arid1a介導的肝細胞重編程過程，Yap與肝細胞重編程基因結合，轉錄激活肝細胞重編程基因的表達，使肝細胞具有響應Hippo/Yap信號通路的分子基礎。
中國科學院分子細胞科學卓越創(chuàng)新中心（生化與細胞研究所）李維平博士、博士研究生何強和中國科學院上海營養(yǎng)與健康研究所楊力光博士為該論文共同第一作者，分子細胞中心惠利健研究員，營養(yǎng)與健康研究所李亦學研究員、李虹副研究員為共同通訊作者。該工作得到第二軍醫(yī)大學附屬長征醫(yī)院謝渭芬課題組的大力支持，并獲中科院、基金委、科技部、上海市科委等資助。
文章鏈接：https://www.cell.com/cell-stem-cell/fulltext/S1934-5909(19)30272-3
圖：Ardi1a調控損傷誘導的肝細胞重編程機制
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